Söz konusu Tokyo Camii’nin tarihine internet sitesinden ulaşmak
mümkün. Bu bilgilere göre, 1920 yılında Rusya’daki devrimden kaçan Kazan Türkleri önce Mançurya’ya oradan da Japonya’ya sığınmışlar. Yıllar içinde Tokyo’da organize olan Kazan Türkleri, Abdurreşid İbrahim liderliğinde örgütlenip 1928’de Mekteb-i İslamiye Okulu açmışlar. 1935’te taşınmaya karar veren Türkler, Shibuya semtinden arazi satın almış ve okulu buraya taşımışlar. 1938 yılında ise okulun hemen yanına Tokyo Camii yaptırılmış. 1986’da yıkılan cami Türkiye’ye hibe edilmiş ve devlet aracılığıyla 1997 yılında yeni bir caminin
temeli atılmış. 2000 yılında cami ibadete açılmış ve o günden bugüne varlığını sürdürüyor. Yani Atatürk’ün cami ile bir bağlantısı bulunmuyor.